发展历程：
中医妇科作为南京太乙堂中医院特色科室之一，在张亚琴主任的带领下，一直秉持中医药诊病治病的理念，运用中医传统理论，致力于具有中医药治疗优势的病种诊治与研究，如不孕症、月经失调、盆腔炎性疾病后遗症、子宫内膜异位症(子宫肌腺症)、更年期综合征等病种。并以临床带动了科研与教学，科研、教学与临床工作相辅相成。
科室诊疗特色：
(一)月经失调
月经失调是女性常见病之一，西医学认为，下丘脑——垂体——卵巢生殖轴的任何部位发生功能或器质性改变，均可导致暂时或长期的排卵障碍，从而引起月经周期、经期或量的异常。
许老认为，排卵障碍导致的不孕症应属中医领域的肾虚范畴。因肾藏精，为生殖之本，它主宰着脑、天癸、冲任、胞宫间的功能调节和控制。此外，“女子以肝为先天”，肝失疏泄，亦会导致女性月经失调，张主任在此基础上创立补肾疏肝之“调冲方”治疗女性月经不调，临床疗效显著。
(二)输卵管因素性不孕
科室陆续开展了中药多途径治疗输卵管因素性不孕症，积累了丰富的对输卵管性不孕的诊治经验及读片经验，对不孕症及不孕相关疾病的多年的经验积累，已形成一整套完整的理论体系和诊治规范。
(三)盆腔炎性疾病后遗症
我们开始采用中药治疗盆腔炎性疾病后遗症。随着该病患者的日益增多，为了进一步提高疗效，我们采用了中药综合治疗盆腔炎的特色疗法(包括内治：口服汤药;外治：静脉点滴中药、中药热敷、中药灌肠、艾灸治疗等)，吸引了全国各地的患者前来住院治疗。
(四)子宫内膜异位症、子宫腺肌病
近年来西医热点研究中关于子宫内膜异位症、子宫腺肌病发病，与女性生殖功能密切相关，多次宫腔操作、人流，以及家族聚集等特点，张主任认为这些与中医先天之本，主生殖之肾气受损与否密切相关，临证有“肾实妇科百病不举，肾虚妇科百病丛生”，因此张主任认为肾虚血瘀才是子宫腺肌病病机关键。在此基础上，许老提出了“病证结合、分因治疗”之法治疗子宫腺肌病，并创立了治疗子宫内膜异位症的临床验方“益坤内异丸”。
(五)其他妇科常见病、多发病、疑难杂病的中医药治疗。
包括月经失调、痛经、更年期综合征、阴道炎、子宫颈病变、反复性流产、子宫内膜异位症、子宫腺肌病、外阴营养不良、等疾病的中医药治疗。
